Program Kemandirian Pesantren merupakan salah satu program prioritas Kementerian Agama RI , untuk mendukung pondok pesantren agar dapat mengalami kemajuan yang sangat pesat, khususnya di bidang usaha /atau bisnis, sehingga dapat meningkatkan perekonomian.
Untuk Provinsi Maluku Utara sendiri, Alkhairaat Percetakan merupakan salah satu unit usaha dari pondok pesantren Alkhairaat Kalumpang Ternate yang mendapatkan bantuan dari Kementerian Agama RI, berupa bantuan Inkubasi Bisnis Kemandirian Pesantren. Adapun tujuan dari program bantuan ini untuk meningkatkan kapasitas Pondok pesantren dalam mengelola unit bisnis sebagai sumber daya ekonomi yang kuat dan berkelanjutan.
Pada tanggal 24 Januari 2024, Kepala Kantor Wilayah Kementerian Agama Provinsi Maluku Utara, H Amar Manaf, mendatangi unit usaha Percetakan Alkhairaat ini sebagai bagian dari pemantauan untuk melihat secara langsung bantuan yang di terima oleh Pondok Pesantren Alkhairaat Ternate, dalam hal ini Pondok Pesantern AlKhairaat Kalumpang Ternate memanfaatkan bantuan inkubasi ini untuk pembelian mesin digital printing, yang juga menjadi bagian usaha fotocopy yang sebelumnya telah ada.
Kakanwil Kementerian Agama Provinsi Maluku Utara yang saat itu di dampingi oleh Pimpinan Pondok Pesantren dan pengurus yayasan Alkhairaat Kota Ternate dalam pemantauannya, Kakanwil mengharapkan melalui unit usaha digital printing ini, Pondok Pesantren AlKhairaat semakin mandiri, maju dan memberikan bermanfaat bagi masyarakat sekitarnya.